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防止西瓜沤根现象的发生对于农业生产是非常重要的。西瓜沤根现象通常是由于土壤过于潮湿和缺氧导致的根部腐烂。为了防止这种现象发生，可以采取一些措施。首先，选择合适的种植地点，避免选择低洼地或者排水不良的地块。其次，适量施用有机肥料，保持土壤透气性和排水性。另外，适时浇水，避免土壤过于潮湿。此外，及时清除病虫害，保持植株的健康生长也是防止沤根现象的关键。最后，选择耐水浸的抗病品种种植，能够减少沤根病害带来的损失。通过这些措施的综合应用，可以有效预防和减少西瓜沤根现象的发生，提高西瓜产量和质量。
防治沤根的方法主要是改善育苗条件，早春西瓜育苗可采用马粪酿热温床或电热温床，这样可保持较高的床土温度，同时苗床要控制浇水，特别是连阴天时不要浇水。对沤根较轻的瓜苗，应加强中耕松土，提高苗床温度，或者结合中耕松土在瓜苗根部撒上1:5的草木灰、细干土吸湿。
改善育苗条件，保持床土温度，控制水肥。
对低温型沤根：一是加强床土管理。施用酵素菌沤制的堆肥或腐熟有机肥，畦面一定要平，播种前最好一次浇足底水。有条件的采用大棚套小棚或大棚覆地膜、地热温室、电热线育苗等方法进行中温育苗。二是加强育苗畦温湿度管理。苗期土温控制在15～25℃，子叶期和两片真叶展开期白天温度控制在22～28℃，夜温18～13℃，土壤含水量控制在土壤最大持水量的60～80%。正确掌握放风时间和通风量大小，使幼苗茁壮成长，发生轻微沤根后，要及时松土土，提高地温，苗期缺水严禁大水漫灌。
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