本书主审周飞虎、龙莉艳、毛智携陈硕 、吴向东、谢尚、陈耀龙、周旭毓主编团队及多位知名专家学者从临床实例出发,以浅显易懂、图文结合的方式介绍了PubMed中基础的检索功能和最实用的检索技巧,助力您的科学研究之路。
在本书预售之际,编辑部为了回馈读者,将以微信连载形式分享部分精彩篇章。今天,我们分享的是“PubMed的MeSH主题词检索”。
PubMed是医药卫生人员最常用的检索平台,除了其提供免费检索、收录的医药卫生数据全面外,最重要的是PubMed的主题词检索在一定程度上可以同时保证检索的查准率和查全率。
有的用户在使用PubMed时并没有刻意的选择主题词检索,也获得了比较好的检索结果,这是因为PubMed关键词检索时会自动将用户输入的关键词进行相应的智能转换,这个转换的过程中有一部分策略就是将关键词与相应的主题词、主题词的入口词匹配,进而进行主题词检索。
一、什么是主题词?
主题词,又称叙词,是经过规范化处理的,以基本概念为基础的表达信息内容的词和词组,也叫受控词。简单讲,就是为了检索需要,将某些具有多种写法或者多个同义词的概念统一到一个规范的名称,这个名称就是主题词。
二、什么是主题词表?
在PubMed中,医学主题词表即MeSH词表,一方面对同义词作为入口词与主题词相关联,在主题词标引后,检索主题词即可同时检索到包含当前检索主题词文献和包含当前检索入口词文献。另一方面,MeSH词表对有上下级关系的词以树状结构关联。可以通过选择树状结构中的上位词和下位词对检索结果进行控制。选择上位词可以扩大检索结果范围,选择下位词可以缩小检索结果范围。
三、什么是主题词标引?
比如“polymerase chain reaction”这个词,有些文献中用的是“polymerase chain reaction”的全称,有的文献用的是“PCR”,有的文献用的是“gene amplification”。在没有主题词标引的数据库中检索时,若仅选一个关键词检索,就会漏掉外用其他词的文献。
PubMed对其收录的MEDLINE文章都进行了主题词标引。对主要研究内容包括“polymerase chain reaction”、“PCR”和“gene amplification”的文献都标引了主题词“polymerase chain reaction”。标引过程中确保了所有标引该主题词的都是关于该主题词概念的文献,这样可以有效地避免漏检。用户在进行主题词检索时,只使用“polymerase chain reaction”这样一个主题词,就可以检索到所有PCR、gene amplification相关的文献了。这个过程既保证了检索的查准率又保证了检索的查全率。
四、如何进行主题词检索?
1.在不了解相应主题词的情况下,使用PubMed的MeSH词表检索。
使用方式一:在首页所有数据库下拉框中选择MeSH,在检索框中输入关键词搜索相应的主题词。
(1)在PubMed首页的下拉菜单中选MeSH检索,如图1所示。
图1 PubMed首页的下拉菜单
(2)在检索框中输入PCR,单击检索,会返回所有PCR相关的主题词,如图2所示。
(3)勾选最相近的主题词后,单击PubMed Search Builder下面的“Add to Search Builder”,再单击“Search PubMed”即可跳转到主题词检索结果页面,如图3所示。
图2 PCR相关的主题词
图3 选择相关主题词添加到检索式
(4)检索结果页面,如图4所示。
图4 使用MeSH检索的结果页面
重复上述1~4步骤,即可进行多次主题词检索,最后到高级检索中进行多个检索词的AND检索或者OR检索,如图5所示。
图5 在高级检索中使用MeSH
使用方式二:单击首页MeSH Database链接或者直接访问如下地址检索:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh/,检索步骤同使用方式一。
2. 在已知主题词的情况下,可以直接在首页检索框输入主题词加上 [MeSH]限定或者使用高级检索的限定主题词字段检索,如图6所示。
图6 在PubMed首页限定MeSH字段检索
五、结语
实践中应该怎么办呢?
首先PubMed的收录范围不仅仅是MEDLINE,其次MEDLINE的最新收录文献还没来得及标引主题词,所以推荐采用“主题词结合关键词”的方式进行检索,提高查全率。
参考文献
[1] Available online:https://www.nlm.nih.gov/mesh/introduction.html.
本文作者
陈硕,毛智
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